No ensino médio, Iwata já mostrava interesse em criar videogames. Ele começou a produzir em sua casa jogos numéricos utilizando uma calculadora eletrônica. Depois do ensino médio, Iwata como a trabalhar como programador para a HAL Laboratory, que é um subsidiária da Nintendo, e também fazia faculdade de Ciências da Computação.
No HAL Laboratory, Iwata ajudou a criar o jogo EarthBound e também vários jogos do Kirby. Em 1993, ele assumiu como presidente da empresa. Em 2000, Iwata começou a trabalhar na divisão de planejamento corporativo da Nintendo, e em 2002, quando o ex-presidente Hiroshi Yamauchi se aposentou, Iwata assumiu o cargo.
Boatos dizem que até hoje Iwata ajuda a HAL Laboratory, e que sempre tem um dedinho dele nos jogos do Kirby. Ele já trabalhou em vários jogos do Mario, Zelda e Animal Crossing.
Feliz aniversário, Iwata!
