A história do jogo, na verdade, se passa antes do Zelda original, e os personagens principais, na verdade são os ancestrais de Link e Zelda. A história é mais ou menos a seguinte: Um feiticeiro chamado Agahnim ganhou domínio sobre Hyrule, e ele está tentando usar seus poderes para libertar Ganon de sua prisão no Dark World, e sem mais spoilers. Ele é o terceiro jogo da franquia e foi lançado em 1992.
Abaixo, você vai ver os primeiros 25 minutos do jogo:
